UF2078 Extracción, Amplificación, Secuenciación y Caracterización de Ácidos Nucleicos, Proteínas y otros Metabolitos Aplican...

UNIDAD FORMATIVA 1. EXTRACCIÓN, AMPLIFICACIÓN, SECUENCIACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS APLICANDO TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR

SCORM 1. APLICAR TÉCNICAS GENERALES DE BIOLOGÍA MOLECULAR EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO.

Electroforesis: fundamentos, tipos mono y bidimensional:

- Preparación de geles.

- Revelado de bandas de cadenas.

- Clasificación y almacenamiento de los residuos electroforéticos.

- Procesado y registro de imágenes.

Análisis de imágenes de geles.

Espectroscopia de visible, UV, IR.

Espectroscopia de fluorescencia molecular.

Espectrofotometría de masas.

Cromatografía -columna flash, TLC y HPLC-.

- Tipos de rellenos de columnas cromatográficas -resinas de absorción y adsorción, gel de sílice fase normal y fase reversa, intercambio iónico, cribado molecular.

Conceptos básicos de resonancia magnética nuclear.

Tecnología de alto rendimiento-high throughput- en genómica, proteómica y metabolómica.

SCORM 2. CONCEPTOS GENERALES DE ÁCIDO NUCLEICO.

Bases nitrogenadas.

Estructura y función de ADN y ARN.

Replicación.

Desnaturalización ADN.

Conceptos de gen, operones, promotores y secuencias consenso.

Genomas y cromosomas.

SCORM 3. APLICAR LAS SECUENCIAS MARCADAS EN LOS PROCEDIMIENTOS ESTABLECIDOS PARA AISLAR ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS.

Extracción, purificación y análisis espectroscópico y/o electroforético de ADN y ARN.

Amplificación por PCR.

Programación del termociclador con temperaturas, tiempos y ciclos preestablecidos.

Concepto de PCR a tiempo real.

Determinación de tamaño y mapas de restricción.

Visualización de geles.

SCORM 4. UTILIZACIÓN DE TÉCNICAS GENÓMICAS APLICABLES EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO.

Análisis de genomas:

- Secuencias automáticas y construcción de contigs: phred-phrap-consed.

- Anotación de genomas: métodos y estrategias. Anotación automatizada vs anotación manual.

- Recursos online: ENSEMBL, NCBI, UCSC, TIGR.

Taxonomía microbiana molecular por secuenciación parcial de genes ribosomales.

Análisis de secuencias.

Elaboración de dendogramas y filogenias.

Clonación: concepto, vectores y enzimas de restricción, ligación y expresión.

Hibridaciones Northern -ARN- y Southern -ADN-.

Hibridación in situ.

Huella genética «DNA Fingerprinting»:

- Concepto y aplicaciones.

Cluster de genes de biosíntesis de metabolitos secundarios:

- Nociones y aplicación.

Tecnología de Microarrays y Chips de ADN y ARN:

- Concepto y aplicaciones.

SCORM 5. CONCEPTOS GENERALES DE PROTEÍNAS.

Definición.

Aminoácidos.

Estructura, conformación y función de proteínas.

Clasificación de proteínas en base a secuencia. Bases de datos: Pfam, PROSITE, ProDom, SMART, InterPro, COGs.

Predicción de estructura secundaria.

Alineamientos estructurales.

Clasificación estructural: bases de datos: SCOP, CATH, FSSP.

Predicción de estructura terciaria. Modelado.

Transcripción y traducción.

SCORM 6. UTILIZACIÓN DE TÉCNICAS PROTEÓMICA APLICABLES EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO.

Extracción de proteínas desde biomasa microbiana o celular:

- Técnicas y seguimiento.

Purificación y análisis por espectroscopia de masas y electroforesis bidimensional tipo SDS-PAGE.

Detección de proteínas por «Western blot», ELISA, técnicas inmunohistoquímicas.

Proteínas recombinantes: Tecnología y aplicación.

Nociones sobre tipos de dianas proteicas más relevantes empleados en cribado-screening.

SCORM 7. APLICAR NORMAS DE SEGURIDAD Y DE PROTECCIÓN AMBIENTAL.

Buenas prácticas de procesos y de laboratorio.

Procedimientos escritos normalizados sobre seguridad.

Manuales de uso de los equipos.

Equipos de protección individual.

Manual de uso de los equipos de prevención y respuesta a la emergencia.

Legislación y normativa sobre biotecnología.

Documentación necesaria para la utilización de los productos y/o servicios biotecnológicos resultantes.